В Преображенском соборе монастыря находится ковчег с частицей мощей святителя и чудотворца Николая. Частица мощей была перенесена в Николо-Угрешский монастырь 22 мая 2000 г. из Греции. Одной из главных святынь монастыря, точнее- собора являются мощи преподобного Пимена Угрешского.